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勞退舊制的退休金專戶結清後，所剩餘的金額應認列企業當年度收入，否則除應補徵營利事業所得稅，將另處以所漏稅額二倍以下之罰鍰。

依所得稅法第33條第1項及第4項規定：「適用勞動基準法之營利事業，依勞動基準法提撥之勞工退休準備金，或依勞工退休金條例提繳之勞工退休金或年金保險費，每年度得在不超過當年度已付薪資總額百分之十五限度內，以費用列支」、「營利事業因解散、廢止、合併或轉讓，依第七十五條規定計算清算所得時，勞工退休準備金或職工退休金準備或職工退休基金之累積餘額，應轉作當年度收益處理」，故營利事業依據勞動基準法，提撥勞工退休準備金時，已允許列報退休金費用，減除稅務成本。因此依所得稅法上開規定，企業將勞退準備金專戶結清後，如有剩餘金額應屬企業所有，並認列為當年度收益。

例如，某A公司1998年依勞動基準法設立「A公司勞工退休準備金監督委員會」，並以委員會名義開立「勞工退休準備金專戶」，按月提撥員工的勞退準備金，並列報為退休金費用。2005年勞退新制上路後，A公司於2011年向主管機關申請，結清勞退準備金專戶，並領回剩餘款約200萬元，此時A公司應將該筆200萬元剩餘款列為2011年度收益。

勞退新制自2005年實施以來，部分企業結清勞退準備金專戶時，在會計處理上常發生專戶內的剩餘金額認列錯誤，導致企業漏申報，除應補徵營利事業所得稅外，將另依所得稅法第110條第1項規定處以所漏稅額二倍以下之罰鍰。