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司法院大法官會議於民國97年6月20日做出釋字第644號解釋，宣告人民團體法（下稱「人團法」）第2條「人民團體不得主張共產主義或分裂國土」的條文違憲，理由是條文牴觸憲法保障人民結社與言論自由，未來政府機關不得禁止主張共產主義或台灣獨立的社團成立。另外，針對人團法第53條前段規定：「社團違反第2條者，主管機關有權不予許可成立的條文。」大法官亦一併宣告違憲。

大法官會議的解釋文認為，人團法上述規定，已就人民政治上言論內容進行審查，違反憲法第23條「比例原則」，踰越限制人民自由必要程度，因此認定人團法第2條、第53條文從解釋文公布的當天起失效。解釋理由書進一步指出，言論自由可滿足人民知的權利，是維持民主多元社會發展不可或缺的工具，不管支持共產主義還是分裂國土，都是政治主張的一種，不應立法賦予主管機關言論審查權，否則將限制人民言論自由的基本權利。

針對釋字第644號解釋，內政部亦表示，未來申請備案的政黨，即使以「中國共產黨」或「台灣共產黨」等為名稱，基於保障言論自由等考量，內政部亦不會以名稱問題做為同意與否的條件，惟在成立後，政黨若發生危害民主憲政秩序情形者，則可移送憲法法庭處理，若法庭裁定構成違憲事實，依法予以解散。