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原傾向中國學歷採認不溯及既往的政策，出現大轉變，除醫學之外的某些領域，將可望溯及既往承認學歷，目前已初步規劃採認中國九八五工程中四十一所中國大學的學歷。所謂的「九八五工程」，是中國為了建設世界一流大學以及國際知名高水準研究型大學而實施的建設工程。由於是在一九八五年五月四日，由中國前國家主席江澤民在慶祝北京大學建校一百周年大會上提出，因此命名為九八五工程。最初包括北京、清華、復旦、浙江、南京、哈爾濱工業、中國科學技術大學與上海、西安交大等共九所大學，隨後擴大加入了國防科技、中央民族、中國農業、華東師範等三十所大學，以建設國際知名大學為目標。

針對上述擬採認中國學歷之政策，教育部長吳清基表示，目前正積極和國會溝通中，希望立法院這會期可通過兩岸人民關係條例等修法，明年秋季即可開始招收中國陸生及採認中國學歷；教育部將在年底選舉後、十二月五日起，全國巡迴舉辦十七場公聽會，傾聽各界意見。

開放名額部分，吳清基表示，初步以○．五％到一％約二千人為原則，各校以二％為上限，名額為外加，不會影響台灣學生權益，初期審慎以對，未來再逐步開放，公立以碩博士為主，私立則不限。

吳清基昨也重申對陸生來台三限六不原則，「三限」包括「限校」、「限量」、「限域」；「六不」則是不涉及加分、不影響本地學生招生名額、不編預算提供獎助學金、不允許校外打工、不可考證照、不會有就業問題。

針對上述擬採認中國學歷之政策，多所國立大學教務主管均表示贊成，期待中國陸生來台有助提升國內研究力及刺激本國學生學習。